中草药数据库TCMID、SymMap、YaTCM、TCMSP
中草药数据库TCMID、SymMap、YaTCM、TCMSP Traditional Chinese Medicine Integrated Database
家中财位
1. 什么是 TCMID?
中医药综合数据库是⼀个提供信息、缩⼩中医药与现代⽣命科学差距的综合数据库。我们收集了有关中药各⽅⾯的信息,包括配⽅、草药和草药成分。我们还收集了现代药理学和⽣物医学所深⼊研究的药物、疾病的信息。我们将两组单独的知识与药物靶点或疾病基因/蛋⽩质进⾏桥梁连接。
众所周知,中医和传统医学是基于不同的哲学。但他们都可以⼈类疾病它们的共同⽅⾯是,它们都通过化学分⼦来疾病,这些化学分⼦与与疾病有关的功能失调的蛋⽩质相互作⽤。两套知识的衔接,不仅将促进中医药的现代化,⽽且有助于传统医学领域的研究⼈员发现潜在的新药和药物相互作⽤的机制。
2. TCMID 是如何建造的?
为了将中药草本成分和它们相互作⽤的蛋⽩质联系起来,我们采⽤了两种⽅法。⾸先,由于中医研究的投⼊⽇益加⼤,已经发现了⼤量的⽣物活性化合物,并推断出其相互作⽤的蛋⽩质靶点。我们进⾏了⽂本挖掘来收集这类信息。其次,现在已经有⼀些数据库托管关于复合蛋⽩相互作⽤的信息,⼀些书籍和论⽂也记录了有关中药材及其成分的相关信息。我们⼿动收集了有关草药及其成分的信息,然后采⽤STITCH(⼀个收集化学物质和蛋⽩质之间的相互作⽤的数据库)将成分(化合物)与蛋⽩质联系起来。
3. 中医国际有限公司与其他中医⽹站有什么区别?
虽然有⼀些数据库记录有关中医的信息,但它们要么只含有少于1500种草药和少于5000种草本成分,要么缺乏有关蛋⽩质-复合相互作⽤的信息。我们的 TCMID 含有 8159 种草药、46914 种中药配⽅和 25210 多种草本成分。
TCMID 的另⼀个亮点是,它使⽤草药和化合物作为桥梁,将 TCM 配⽅与蛋⽩质连接。因此,它可⽤于分析公式的多⽬标效应,并探索每种公式的潜在分⼦机制。
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我们还将药草成分与疾病 (OMIM)、药物 (药物库) 联系起来。它将提供丰富的信息,以帮助研究⼈员的药物发现。例如,如果化合物和经批准的药物瞄准相同的蛋⽩质,该化合物可能是新药最有希望的候选药物。如果化合物和疾病具有相同的蛋⽩质,含有化合物的药草可能对此病有⼀定影响。
4. 如何在 TCMID 中搜索信息?
当前版本中有六种查询 TCMID 的⽅法
处⽅查询:现在可⽤的处⽅信息是中⽂的,所以⽤户可以⽤汉语拼⾳的名字搜索处⽅。
草本查询:草本可以查询其名称在汉语拼⾳名称或英⽂名称。
成分查询:查询都接受复合名称、STITCH 数据库 ID、CAS 编号。
疾病查询:我们已经从 OMIM 收集了疾病信息,因此⽤户可以使⽤ OMIM 表型名称或表型 ID 进⾏查询。
药物查询:可以使⽤药物名称及其药物库 ID。
⽬标查询:接受任何类型的蛋⽩质名称或 Uniprot AC ID。
5. 药草的五个属性是什么?
药草有五个属性。它们是⾃然,味道,通道性,功能和指⽰。⾃然是指基于患者对药草反应的基本特征,它有四种特性:冷、冷、暖、热;味道表⽰药草对⼈体的⾏为,它包括五个字:辣,酸,甜,苦,
盐;通道性研究描述了药草对⾝体某⼀部位的选择性效果,它包括⼗⼆种不同的器官:⼼脏、肝脏、脾脏、肺、肾、胃、⼤肠、⼩肠、膀胱、胆囊、腹⽔、三个加热器;功能说明了药草的效果的机制。例如,⼀种常见的药草"中国安吉莉卡"具有"协调⾎液","调节男性"和"湿润肠"的功能;指⽰是指药草的疾病或症状。⼏种草药按⼤师、顾问、⼠兵和公会的顺序组成⼀个公式,⽽后来的草本则表⽰不太重要。
6. 中医百科全书的数据资源是什么?
处⽅主要是通过从书籍和发表⽂章的⽂本挖掘收集的。草药信息主要从中医ID数据库和⽂本挖掘中提取。通过梳理来⾃中药、TCM-ID和⽂本挖掘
⽅法的信息,输⼊了有关草药成分的数据TCM@Taiwan,如名称和结构。从药物银⾏和OMIM检索到疾病及其相关蛋⽩质、药物及其靶点的信息。
假面骑士w剧场版3SymMap
介绍
SymMap通过内部分⼦机制和外部符号ptommapping将中医(TCM)与现代医学(MM)集成在⼀起。
它含有499种在中国药典中注册的草药,含有19,595种成分,以及1,717种在中药(TCM交集)中使⽤的相应症状。这些中医症状被严格映射到现代医学中使⽤的961个症状术语(MM症状)。此外,SymMap 收集了这些草药的关联⽬标(基因)和疾病,⽆论是通过症状-疾病关联,还是通过成分-⽬标关系。总共列⼊了4 302个⽬标和5 235种疾病。
⽬前,SymMap 提供了⼤量有关草药、中医症状、MM 症状、成分、靶点和疾病的描述性信息。它还通过直接关联或间接统计推理,提供这六种组件之间的成对关系。总之,它显⽰了⼀个⽹络,⽤于所有六个组件之间的综合关系。
YaTCM
YaTCM (nankai.edu)
YaTCM(另⼀个中医数据库),⼀个免费的基于⽹络的⼯具包,它提供全⾯的中医信息,并配备了分析⼯具。它包含47,696种天然化合物、6,220种草药、18,697个⽬标(包括3,461个⽬标)、1,907个预测⽬标、390个通路和1,813个处⽅。YaTCM允许⽤户(1)通过相似性搜索和⼦结构搜索识别对中药材⾄关重要的潜在成分,(2)通过通路分析和⽹络药理学分析调查中药或处⽅的作⽤机制,(3)通过多投票化学相似性组合⽅法预测中药分⼦的潜在靶点,(4)探索功能相似的草布对。所有这些功能都可能导致⼀个系统⽹络,⽤于可视化中医⾷谱、草药、成分、明确或应定蛋⽩质靶点、通路和疾病。本⽹络服务有助于揭⽰中医的作⽤机制,揭⽰中医理论的精髓,进⽽促进药物的发现过程。
杨梅怎么吃TCMSP - Traditional Chinese Medicine Systems
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Pharmacology Database and Analysis Platform
八一建军节的短句(tcmspw)
Jinlong Ru; Peng Li; Jinan Wang; Wei Zhou; Bohui Li; Chao Huang; Pidong Li; Zihu Guo; Weiyang Tao; Yinfeng Yang; Xue Xu; Yan Li; Yonghua Wang; Ling Yang. TCMSP: a database of systems pharmacology for drug discovery from herbal medicines. J 2014 Apr 16;6(1):13.
Cheminformatics. 2014
药TCMSP
化学品、靶点和药物
、靶点和药物靶点⽹络,以及相关的药
包括化学品
TCMSP是中草药独特的系统药理学平台,可以捕捉药物、靶点和疾病之间的关系。该数据库包括
⾎脑屏障、aq尿
尿溶性等天然化合物的药代动⼒学特性。这⼀突破引发
肠道上⽪渗透性、⾎脑屏障、aq
物靶点疾病⽹络
药物性、肠道上⽪
物靶点疾病⽹络,以及涉及⼝服⽣物利⽤性、药物
了对各种中药材候选药物寻的新兴趣。

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