gsea打分的分组
在GSEA打分的分组过程中，首先需要准备样本的全基因组RNA测序数据及样本的表型标签信息。接着，基于某个合适的指标（如差异倍数FC）对所有基因进行排序，获得排序基因列表。
对于样品的分组，需要按照一定的格式整理数据。例如，第一行需要标明样本总量、分组/类型的数量以及固定格式”1”；第二行则是固定格式”#”，后面接上分组的名称1，分组名称2等，这些分组名称可以与样本名称不同，不会影响数据读取；最后一行则填写每个样本具体的分组类型。分组名称大全
当完成上述步骤后，可以运用GSEA对样品队列进行高低分组。在进行基因集富集分析时，GSEA支持多种统计方法来计算分组间的差异，如signal2noise、T-test、Ratio of classes(差异倍数)或 Diff of classes(差异绝对值)等。选择哪种方法取决于您的样本是否有生物学重复等信息。

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