Cytoscape史上最全攻略感恩节祝福语言简短的
今天还是讲Cytoscape,虽然已经写了很多相关的⽂章,但是依然有童鞋在问哪⾥可以下载Cytoscape这样没有营养的问题,这让本宫⽆⽐⽆⽐的痛⼼!!!
所以今天本宫会很详细、⾮常详细、巨详细、史⽆前例地详细、前⽆古⼈,后⽆来者地详细讲解如何使⽤Cytoscape。
Cytoscape是⽤于可视化⽹络数据的⼀个⾮常强⼤的⼯具,⽐如说表现⼀组基因间的相互关系,
数据的表现⼒上孰优孰劣⼀⽬了然。
⽂本形式和⽹络图形式,在数据的表现⼒上睡吧睡吧我亲爱的宝贝
点(node)和线(edge)是⽹络图的两个核⼼要素。
我们做各种各样的⽹络图,归根结
是⽹络图的两个核⼼要素。我们做各种各样的⽹络图,归根结底是对图中的点和线进⾏注释,我们通过改变点和线的样式来对点和线赋予各种各样的信息,从⽽实现数据的可视化。
息,从⽽实现数据的可视化
很多童鞋可能在下载这⼀步就放弃了,因为下载速度可能会很慢,200M的宽带可能只有2kb的
见⽂末⽹盘链接)。
下载速度。本宫送佛送到西,翻过去给你们把⽕种带回来(见⽂末⽹盘链接)
安装的时候先安装java,安装好了之后需要设置环境变量
在环境变量中,要修改两个地⽅,⼀个是添加JAVA_HOME。选择“新建”,变量名填上
JAVA_HOME,变量值填上C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_151,在java的安装过程中,默认⼀直下⼀步安装,所以装在C盘,如果你在安装过程中改了,那可能是D盘或者E盘,那么变量值要做相应的更改。
还要修改⼀个地⽅,就是Path,添加JAVA的变量值到Path中,选择Path,然后点“编辑”,在最后⾯添加如下语句;%JAVA_HOME%\bin;
打开命令提⽰符cmd,输⼊java -version,如果能正常显⽰,那表明装好了,你就可以装Cytoscape了
春眠不觉晓的意思>最新贷款利率虽然⽹盘⾥的是最新版本3.60,但是不知道重新安装需不需要重新下载插件什么的,时间所
如果⼤家在使⽤过程中发现什么差别,请在迫,今天给⼤家所做的演⽰都是基于3.42版本,如果⼤家在使⽤过程中发现什么差别,请在⽂末留⾔。
⽂末留⾔
欢迎页⾯
先来看⼀下Cytoscape的欢迎页⾯,最主要的功能就是数据导⼊
数据导⼊了,在这⾥我们可以导⼊本地⽂件建⽴⽹络,也可以从数据库获取数据建⽴⽹络。
关于教师节的诗朗诵本地⽂件的基本格式⼤家上⾯已经看到了,就是两列节点信息,处于同⼀⾏的两个节点之间存在连线。所以这个表⾥基本的点和线的信息都已经有了。
椒盐排骨的做法再来看⼀下从数据库导⼊数据,输⼊感兴趣的基因名称,然后选择相应的数据库,导出数据。
从下⾯这么多个数据库中得到了N个⽹络
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