DOI:10.13602/j.cnki.jcls.2021.02.17·质量管理研究·
不同核酸提取方法和新型冠状病毒核酸检测试剂室间质评结果分析
余汉忠1,牛璐璐1,孔倩倩1,李小川2,蔡佩君2,王丽1(1.中国矿业大学附属医院徐州市第一人民医院检验科,江苏徐州221009;2.中国矿业大学化工学院,江苏徐州221009)
摘要:目的 分析2种不同核酸提取方法和2种新型冠状病毒核酸检测试剂检测室间质评样本的结果,进行性能比较。方法
收集2020年江苏省临床检验中心和国家卫生健康委临床检验中心发放的新型冠状病毒核酸检测室间质量评价样本共15份,用2种常用核酸提取方法(磁珠法、核酸释放剂法)、2个厂家实时荧光定量PCR核酸扩增检测试剂检测,进行质评物核酸
2022年高考分数查询提取和扩增,根据不同试剂组合检测结果比较相关试剂性能。结果 根据国家卫生健康委员会临床检验中心和江苏省临床检验中心结果反馈,15份质评样本中,包括10份新型冠状病毒核酸阳性样本,5份阴性样本。核酸磁珠提取法+A厂家核酸检测试剂阳性质评样本ORF1ab和N基因检出率均为100.00%,双基因同时检出率均为100.00%,有效检出率为100.00%;核酸释放剂法+B厂家核酸检测试剂阳性质评样本ORF1ab检出率为70.00%,N基因检出率为90.00%,双基因同时检出率为
70.00%,有效检出率为90.00%;核酸磁珠提取法+B厂家核酸检测试剂阳性质评样本ORF1ab和N基因检出率均为100.00%,双基因同时检出率均为100.00%,有效检出率为100.00%。3种试剂组合对阴性质评样本均为未检出,阴性结果符合率均为
100%。结论 不同核酸提取方法及核酸检测试剂对质评样本检测结果不同,核酸释放剂法的核酸提取性能有待提高。
关键词:新型冠状病毒;室间质评;核酸检测;核酸提取方法
中图分类号:R446.5 文献标志码:A
2019新型冠状病毒(2019novelcoronavirus,
alwaysonline是什么意思2019 nCoV)核酸检测在疫情防控中至关重要。各厂家快速研发的各种核酸提取和检测试剂盒并不
稳定[1],在检测前需要进行充分的性能验证及试剂比对,并积极开展实验室间的室间质评比对活动,才能确保检测结果的准确和可靠。本研究对徐州市第一人民医院PCR实验室采用的2种核酸提取方法和2种2019 nCoV核酸检测试剂检测室间质评样本的结果进行比较分析,结果报道如下。
1 资料与方法怎么删除ie浏览器
1.1 样本 2020年江苏省临床检验中心5月17日发放的2019 nCoV核酸检测室间质量评价样本5
份(样本号:209601、209602、209603、209604、
209605)和2020年国家卫生健康委临床检验中心6月17日发放的2019 nCoV核酸检测室间质量评价
样本10份(样本号:202001、202002、202003、202004、202005、202006、202007、202008、202009、202010)。
1.2 仪器与试剂 SLAN 96P全自动荧光PCR仪(上海宏石公司),AW 1000全自动核酸提取仪(江苏硕世公司);新型冠状病毒(2019 nCoV)核酸检测试剂盒(批号:20200302)、磁珠法核酸提取试剂盒(批号:SDK60105)源自江苏硕世公司(A公司),新型冠状病毒(2019 nCoV)核酸检测试剂盒(批号:2020076)、核酸释放剂(批号:2020043)源自湖南圣湘公司(B公司)。
1.3 方法 接收室间质评样本当天即进行检测。根据《新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测技术
指金边白菜是什么菜系
南(第五版)》[2]要求进行生物安全防护。根据核酸提取和扩增试剂的不同,分为3种组合。组合1:A公司磁珠法核酸提取试剂+核酸检测试剂,组合
2:B公司核酸释放剂+核酸检测试剂,组合3:A公司磁珠法核酸提取试剂+B公司核酸检测试剂。
1.3.1 核酸提取 (1)磁珠法:用A公司核酸提取试剂盒及AW 1000全自动核酸提取仪,质评样本
充分混匀后,吸取200μL加入相应深孔板第一列,放入提取仪,选择相应程序自动提取;(2)核酸释放剂法:八联管中加入10μLB公司样本核酸释放剂,质评样本充分混匀后,吸取10μL加入八联管,
基金项目:2020年中国矿业大学新型冠状病毒(2019 nCoV)防治科研攻关应急专项资助项目(2020XGYJ02)。 作者简介:余汉忠,1985年生,男,副主任技师,硕士,主要从事分子诊断学研究。
通信作者:王丽,主任技师,E mail:jsxzwdl@163.com。
充分混匀,静置10min。均按照试剂说明书进行。1.3.2 核酸扩增 用SLAN 96P全自动荧光PCR仪及核酸检测试剂,根据试剂说明书配制反应体系并设置反应程序,进行扩增检测及检测结果判定。A公司核酸检测试剂PCR反应体系共25μL,包括RT PCR反应液7.5μL,酶混合液5μL,新冠三重反应液4μL,去RNA酶H2
O3.5μL,核酸模板样本量5μL。PCR扩增参数为:逆转录50℃
30min;
预变性95℃5min;变性95℃40s,退火、延伸、测荧光55℃40s,
45个循环。结果判读:FAM(ORF1ab)、ROX(N)、HEX(内标)
3个通道Ct≤35且扩增曲线为S形曲线者,
判定为该基因检测结果为阳性;Ct>38判定为该基因检测结果为阴性;35<Ct≤38判定为该基因结果为检测灰区,
需复查,复查后若2次检测结果都在“灰区”
,
则判断为检出,取2次结果的平均值作为上报结果Ct值。B公司核酸检测试剂的PCR反应体系共50μL,
包括RT PCR反应液26μL,酶混合液4μL,核酸模板样本量20μL;PCR扩增参数为:
逆转录50℃30min;
预变性95℃1min;变性95℃15s,退火、延伸、测荧光60℃30s,45个循环;冷却
25℃10s。结果判读:FAM(ORF1ab)、ROX(N)、HEX(内标)
3个通道Ct≤40且扩增曲线为S形曲线者判定为该基因检测结果为阳性,Ct>40判定为该基因检测结果为阴性,扩增曲线异常时需复查。1.3.3 质量控制 试剂盒自带阴性和阳性对照,若阴性和阳性对照检测结果在控,则该批次试验结果有效;若阴性和阳性对照检测结果不在控,则该批次试验结果无效。设置环境评估样本1个,为阴性
对照开口放置于PCR实验室Ⅱ区过夜,
用质评样本检测方法检测,评估有无环境污染。
红领巾心向党资料2 结果
本实验室根据标准操作规程进行操作后结果
良好,阴性对照、阳性对照、环境评估样本均在控制范围内。根据国家卫生健康委临检中心和江苏省临床检验中心的室间质评结果回报,除209602、209604、202001、202006、202008号样本为双位点未检出外,其余室间质评样本均为双位点阳性。3种试剂组合对阴性质评样本均为未检出,阴性结果符合率均为100%,对阳性质评样本各基因的检出结果见表1。
表1 不同试剂组合对阳性质评样本的检出率分析[n(%)]
实验方法
阳性质评样本数(
n)不同基因检出率ORF1abN双基因
同时检出率有效检出率
磁珠法+A公司核酸检测试剂1010(100)10(100)10(100)10(100)核酸释放剂法+B公司核酸检测试剂107(70)9(90)7(70)9(90)磁珠法+B公司核酸检测试剂
什么是理事会10
10(100)10(100)10(100)
10(100)
3 讨论
准确的2019 nCoV病原鉴定对新型冠状病毒
肺炎疑似患者方案的确定、感染的控制都发挥着关键作用[3 4
]。本研究选取了徐州市第一人民医院现在使用的2种2019 nCoV核酸检测试剂及2种提取方法对室间质评样本进行分析。从实验结果可以看出,磁珠法提取的核酸用A和B公司核酸检测试剂检测的有效检出率都能达到100%。但B公司核酸释放剂法提取后的核酸使用B公司核酸检测试剂对阳性质评样本ORF1ab基因的检出率
为70%,N基因检出率为90%,说明核酸提取效果不佳。而磁珠法提取的核酸再用B公司核酸检测试剂检测质评样本的结果表明,所有阳性样本的Ct值均小于其他2种组合,说明此试剂组合对室间质评阳性样本均能更灵敏地检出靶基因[5
]。本实验仅对2种某一批号的试剂用国家卫健委临检中心和江苏省临床检验中心的室间质评样本作了简单的比较分析,因为样本量较少,可能并
不代表2种试剂的整体检测能力。目前国内疫情
放缓,研究对象缺乏,若能获取大数量的阳性样本,可以对不同提取和扩增试剂进行更全面的评价。
4 参考文献
[1]熊丹,阚丽娟,王萌萌,等.七种国产新型冠状病毒核酸检测试剂盒的一致性和检出能力评价研究[J].中华检验医学杂志,2020,43(8):787 793.[2]林铃,李太生.国家卫生健康委员会《新型冠状病毒感染的肺
炎诊疗方案(试行第五版)》解读[J]
.中华医学杂志,2020,100(00):E001 E001.[3]王旭东,施健,丁伟峰,等.2019新型冠状病毒核酸检测的研
究状况与应用探讨[J].临床检验杂志,2020,38(2):81 84.
[4]张瑞,李金明.如何减少新型冠状病毒核酸检测的“假阴性”[J].中华医学杂志,2020,100(00):E008 E008.[5]陈克平,徐百泉,李丽.Ct值与浓度对数在HBV核酸定量检测
室内质控中的作用[J].临床检验杂志,2010,28(4):310 311.
(收稿日期:
2020 09 14
)(本文编辑:
刘)
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