《名侦探柯南》全集目录
注：内容来自百度百科。括号内为国语版集数。
“★”标注表示加长版特别篇，“◆”表示动画原创（即漫画原作中没有的），“B”表示出现黑衣组织，“F”表示出现FBI，“C”表示出现CIA，“S”表示出现工藤新一，“X”表示出现服部平次，“K”表示出现怪盗基德。
1996年（1~42）
1 云霄飞车杀人事件 B/S
2 董事长千金事件
3 偶像密室杀人事件
4 大都会暗号地图事件
5 新干线大爆破事件
6 情人节杀人事件◆
7 每月一件礼物恐吓事件
8 美术馆杀人事件
9 天下第一夜祭杀人事件
10 足球选手恐吓事件
11（11~12） 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件★
12（13） 步美被事件
13（14） 奇怪的寻亲杀人事件
14（15） 谜样的讯息狙击事件◆
15（16） 消失的尸体杀人事件
16（17） 古董收藏家杀人事件
17（18） 百货公司挟持事件◆
18（19） 六月新娘杀人事件
19（20） 电梯杀人事件◆
20（21） 鬼屋杀人事件
21（22） 电视台外景队杀人事件◆
22（23） 豪华客轮连续杀人事件（前篇）
23（24） 豪华客轮连续杀人事件（后篇）
24（25） 丧失记忆的美女事件◆
25（26） 真假人质绑票事件◆
26（27） 爱犬约翰杀人事件◆
27（28） 小五郎同学会杀人事件（前篇）
28（29） 小五郎同学会杀人事件（后篇）
29（30） 计算机杀人事件◆
30（31） 不在场证明杀人事件◆
31（32） 电视台杀人事件
32（33） 咖啡厅杀人事件
33（34） 侦探团生还事件◆
34（35） 山庄绷带怪人杀人事件（前篇）
35（36） 山庄绷带怪人杀人事件（后篇）
36（37） 星期一晚上7:30杀人事件◆
37（38） 仙人掌花杀人事件◆
38（39） 赤鬼村火祭杀人事件
39（40） 企业家千金杀人事件（前篇）
40（41） 企业家千金杀人事件（后篇）
41（42） 优胜锦旗被割事件◆
42（43） 卡拉OK厅杀人事件
1997年（43~85）
43（44） 江户川柯南诱拐事件
44（45） 堀田三兄弟杀人事件◆
45（46） 敷面膜杀人事件◆
46（47） 雪山山庄杀人事件
47（48） 健身俱乐部杀人事件◆
48（49） 外交官杀人事件（前篇） X
49（50） 外交官杀人事件（后篇） S/X
50（51） 图书馆杀人事件
51（52） 高尔夫练习场杀人事件◆
52（53~54） 雾天狗传说杀人事件★
53（55） 神秘凶器杀人事件◆
54（56） 电玩公司杀人事件 B
55（57） 列车手法杀人事件◆
56（58） 清洁车杀人事件◆
57（59） 福尔摩斯迷杀人事件（前篇） X
58（60） 福尔摩斯迷杀人事件（后篇） X
59（61） 首次购物杀人事件◆
60（62） 插画画家杀人事件
61（63） 幽灵船杀人事件（前篇）◆
62（64） 幽灵船杀人事件（后篇）◆
63（65） 大怪兽哥梅拉杀人事件
64（66） 第三个指纹杀人事件◆
65（67） 螃蟹和鲸鱼事件◆
66（68） 夜路杀人事件◆
67（69） 舞台女演员杀人事件◆
68（70） 暗夜男爵杀人事件（事件篇）
69（71） 暗夜男爵杀人事件（疑惑篇）
70（72） 暗夜男爵杀人事件（解决篇）
71（73） 米花之狼杀人事件◆
72（74） 三胞胎别墅杀人事件
73（75） 少年侦探队遇难事件◆
74（76） 死神阵内杀人事件◆
75（77） 金融公司社长杀人事件
76（78~79） 柯南VS怪盗基德★ K
77（80） 名门连续惨死事件（前篇） X
78（81） 名门连续惨死事件（后篇） X
79（82） 银行强盗杀人事件◆
80（83） 流浪画家杀人事件◆
81（84） 当红歌星事件（前篇）
82（85） 当红歌星事件（后篇）
83（86） 综合医院杀人事件◆
84（87） 滑雪别墅杀人事件（前篇）
85（88） 滑雪别墅杀人事件（后篇）
1998年（86~128）
86（89） 诱拐现场特定事件◆（注：该集根据漫画《名侦探柯南特别篇》第1卷改编，并非青山刚昌的原作）
87（90） 白鹤报恩杀人事件◆
88（91） 德休拉别墅杀人事件（前篇）◆
89（92） 德休拉别墅杀人事件（后篇）◆
90（93） 花香杀人事件◆
91（94） 抢匪住院事件
92（95） 恐怖登山杀人事件（前篇）◆
93（96） 恐怖登山杀人事件（后篇）◆
94（97） 雪女传说杀人事件◆
95（98） 小五郎约会杀人事件◆
96（99~102） 走投无路的名侦探！连续两大杀人事件★
97（103） 离别美酒杀人事件◆
98（104） 名陶艺家杀人事件（前篇）
99（105） 名陶艺家杀人事件（后篇）
100（106） 初恋情人回忆事件（前篇）
101（107） 初恋情人回忆事件（后篇）
102（108） 古装演员杀人事件（前篇）
103（109） 古装演员杀人事件（后篇）
104（110） 盗贼集团别墅事件（前篇）
105（111） 盗贼集团别墅事件（后篇）
106（112） 新闻照片杀人事件◆
107（113） 鼹鼠星人之谜事件（前篇）◆
108（114） 鼹鼠星人之谜事件（后篇）◆
109（115） 侦探团大追击事件◆
110（116） 烹饪教室杀人事件（前篇）◆
111（117） 烹饪教室杀人事件（后篇）◆名侦探柯南怪盗基德出场
112（118） 帝丹小学七大离奇事件
113（119） 白海滩杀人事件◆（注：该集根据漫画《名侦探柯南特别篇》第1卷改编，并非青山刚昌的原作）
114（120） 有氧潜水杀人事件（前篇）
115（121） 有氧潜水杀人事件（后篇）
116（122） 推理小说家失踪事件（前篇）
117（123） 推理小说家失踪事件（后篇） X
118（124~125） 浪花连续杀人事件★ X
119（126） 假面超人杀人事件◆
120（127） 蜜蜂鸡尾酒杀人事件◆
121（128） 浴室密室事件（前篇）
122（129） 浴室密室事件（后篇）
123（130） 天气预报小事件◆
124（131） 神秘的狙击者杀人事件（前篇）◆
125（132） 神秘的狙击者杀人事件（后篇）◆
126（133） 旅行剧团杀人事件（前篇）◆
127（134） 旅行剧团杀人事件（后篇）◆
128（135） 黑衣组织10亿元抢劫事件◆ B（注：部分情节来自漫画第2卷，但主体案件为原创）
1999年（129~173）
129（136~139） 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★ B
130（140） 竞技场无差别胁迫事件（前篇）
131（141） 竞技场无差别胁迫事件（后篇）
132（142） 魔术爱好者杀人事件（事件篇） K
133（143） 魔术爱好者杀人事件（疑惑篇） K
134（144） 魔术爱好者杀人事件（解决篇） K
135（145） 消失的凶器搜索事件◆
136（146） 蓝古堡探索事件（前篇）
137（147） 蓝古堡探索事件（后篇）
138（148） 最终播映杀人事件（前篇）
139（149） 最终播映杀人事件（后篇）
140（150） SOS！步美传达的讯息◆
141（151） 结婚前夕密室事件（前篇） X
142（152） 结婚前夕密室事件（后篇） X
143（153） 疑惑的天体观测◆
144（154） 上野出发的北斗星3号（前篇）
145（155） 上野出发的北斗星3号（后篇）
146（156） 本厅刑事恋爱物语（前篇）
147（157） 本厅刑事恋爱物语（后篇）
148（158） 路上电车紧急刹车事件◆
149（159） 游乐园高空弹跳事件◆
150（160） 汽车爆炸事件的真相（前篇）◆
151（161） 汽车爆炸事件的真相（后篇）◆
152（162） 神秘老人失踪事件◆
153（163） 园子危险的夏日物语（前篇）
154（164） 园子危险的夏日物语（后篇）
155（165） 水中钥匙密室事件◆
156（166） 本厅刑事恋爱物语2（前篇）
157（167） 本厅刑事恋爱物语2（后篇）
158（168） 沉默的环状线◆
159（169） 诡异的五重塔传说（前篇）◆
160（170） 诡异的五重塔传说（后篇）◆
161（171） 流经流水亭的杀机◆
162（172~173） 飞天密室 工藤新一最初的事件★ S
163（174） 月亮、星星与太阳的秘密（前篇）
164（175） 月亮、星星与太阳的秘密（后篇）
165（176） 少年侦探队消失事件◆
166（177） 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（事件篇） X
167（178） 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（疑惑篇） X
168（179） 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（解决篇） X
169（180） 维纳斯之吻◆
170（181） 黑暗中的死角（前篇）
171（182） 黑暗中的死角（后篇）
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