第一章 进入PubMed魔法学校——PubMed 概述
无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:bi.v/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。
进入PubMed的主界面后, 首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和“Advanced search”功能键。这是PubMed的核心部分。在主界面的下方有:
● Journals Database:收录的学术期刊数据库。
● MeSH Database:检索MeSH数据库。
● Single Citation Matcher:单引文匹配,输入期刊的信息可以到某单篇的文献或整个期刊的内容。
● Batch Citation Matcher:用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
● Clinical Queries:这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4 个范围:、诊断、病原学与预后。
● Topic-Specific Queries:特定主题的查询。
Related Resources
● Order Documents可以使用户在当地得到文献的全文,但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。
● Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。Grateful Med也提供MEDLI NE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
● Consumer Health提供与MEDLINE plus的链接,MEDLINE plus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。
法学专业就业方向● Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。利用左侧框的这些服务,我们不仅能够进行功能更加强大的检索,而且还能得到不少非常有用的服务。这些都将在后续章节中介绍。
在以后的章节中,我们将逐步深入地了解PubMed,相信通过这些章节的学习,我们可以真正熟练掌握PubMed,从而使自己的工作事半功倍。
第二章 PUBMED简单检索技巧
在这一章里,我们将对如何应用PubMed这一得力助手检索文献,作一简单介绍。
1.PubMed检索系统
当你打开浏览器,在地址栏内键入bi.v/PubMed/后,就进入了PubMed检索系统主页。
2.利用检索框进行检索
在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。在检索框中输入查询词,然后单击"Search"按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除PubMed数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN, STRUCTURE,POPSET等等。
这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符,然后回车一敲便可万事大吉。其实不然,每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下建议仅供读者参考:
● 明确你索要检索的关键概念及词语,即关键字;
● 考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;
● 通过限定DATES,STUDY GROUP等,精炼你的检索范围;
● 多向有经验的人求教,因为不同的专业背景以及个人的差异,都有可能形成不同的方法和技巧。
3.通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率
最常用的三种布尔运算即是AND,OR和NOT。注意,必须是大写字母。
● AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪儿,只要他们都出现在检索文章的某一处,就将其列出。
● OR则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。
● NOT为什么最近强调应急物资储备运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时,除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章,同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。
4.PUBMED的检索类型
通常我们所要查询的单词类型大致可以分为:
● 词语(主题)检索:这时我们在PubMed主页的检索框中键入的是英文单词或短语(大写或小写均可)。然后回车或点击"Search",PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。例如:键入"vitamin c common cold"后回车或点击"Search",PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
● 著者检索:当我们所要查询的是著作者时,在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为:"著者姓 空格 名字首字母缩写",例如smith ja,然后回车或点击"Search",系统会自动到著者字段去检索,并显示检索结果。
● 刊名检索:在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号,例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell,或59-1524,然后回车或点击"Search",系统将在刊名字段检索,并显示检索结果。
● 日期或日期范围检索:可以在检索框中键入日期或日期范围,然后回车或点击"Search",系统会按日期段检索,并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式YYY/MM/DD;如:1999/09/08 。也可以不录月份和日子,如:2000或1999/12。
● 检索期刊子集(辑):检索的格式为:检索词AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种:Abridged Index Medicus(有120种重要核心期刊 )、Dental和Nursing。分别使用jsubseta感谢幼儿园小班老师的话简短,jsubsetd, jsubsetn进行限定。
● fun检索带文摘的记录:检索的格式为:检索词AND has abstract,如:liver cancer AND has abstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其MEDLINE记录中没有文摘。
送男生什么生日礼物 ● 布尔逻辑检索:PubMed系统允许使用布尔逻辑检索,只要在检索框中键入布尔逻辑运算符(AND,OR或NOT)。具体使用时要注意的问题,详见上第3点所述。
5.如何处理检索结果
当你点击"Search"或回车后,PubMed将会自动运行检索命令,在屏幕的下方显示出符合检 索要求的项目,并且在查询框内保留原检索词。此时要注意的是符合检索要求的项目是以Summary(简要格式)显示出来的,就是列出作者,文章题目,以及文章来源的一些信息。
利用Display Settings下拉菜单还可以选择其他显示格式,点击Apply键后,系统按所选格式显示全部检索结果。
如果只需要显示其中一部分记录,则需点击该记录左边的查询框标记后,再点击Apply键;如果只需显示一条记录,则可直接点击该记录中的作者姓名超链接,系统会自动显示该记录的文摘格式。
还有一点,系统所设定的默认值为每页显示20条选项,这点可以在Display Settings下拉菜单处选择更改。
如果选中所感兴趣的内容,即可进行保存,打印等等操作。PubMed系统允许最多可
保存5000条记录。要保存全部检索结果时,打开"Send to"下拉菜单选择File格式,然后点击Create File键;要保存特定记录时,点击记录左边的选择框予以标记后,再点击Create File键。
使用浏览器的打印功能,即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格式,请先在Display Settings下拉菜单处点击Summary(text)或Abstract(text)键,然后再打印。
下一章我们将用几个实例来使大家熟悉以上检索技巧。
第三章 PUBMED简单检索实例
在上一章里,我们已经对如何用PubMed来查询我们感兴趣问题的文献。在这一章,我们可以通过几个简单的实例来具体熟悉PubMed的用法。
例一
1. 明确所要检索的内容。如果我们要查询的问题是"维生素C对于普通感冒的防治作用
"。首先我们应分析这一问题中的关键词语,主要由"维生素C",和"普通感冒"构成。即"VITAMIN C"和"COMMON COLD"。
2. 分析所要检索的两个相关词语的关系。根据我们的日常生活经验,可以将两个关键词之间的关系定义为"AND",于是我们可以在检索框内键入"VITAMIN C AND COMMON COLD".,然后点击"Search",进行检索。下面的画面即为经过上面检索过程后所得到的相关文章。
3. 以上初步检索后所显示的结果都以默认的SUMMER格式显示出来,在经过对SUMMER的阅读后,我们可以进一步筛选文献的内容。如我们感兴趣的是第二、三、五篇的话,选中这几篇文献左侧的方框。如果我们想要同时看到这几篇的Abstract,在Display Settings下拉菜单选择Abstract,然后点击Apply键,即可看到所要结果。
古代对医学界的称谓例二
1. 如果这一次我们想要查的是与一个作者相关的文章,如这位作者的名字是Hemila h,则我们所要检索的内容就很明确了,是这位作者的名字Hemila h。在检索框内输入Hemila h,点击Search键,屏幕上即会显示出与这位作者相关的文献。
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