瘤胃微生物rna提取中样品前处理方法的优化
㊀基金项目:国家重点研发计划项目(2017YFD0500502)ꎻ国家自然科学基金项目(31430081)ꎻ中国农业科学院农业科技创新㊀工程重大产出科研选题项目(CAAS ̄ZDXT2019004)ꎻ中国农业科学院科技创新工程项目(ASTIP ̄IAS12)㊀
作者简介:刘思佳㊀女ꎬ硕士研究生ꎮ研究方向为营养与饲料科学ꎮTel:010 ̄62816069ꎬE ̄mail:liusijia1214@163.com㊀∗通讯作者ꎮ男ꎬ博士ꎬ研究员ꎮ研究方向为反刍营养与饲料科学ꎮTel:010 ̄62816069ꎬE ̄mail:jiaqiwang@vip.163.com㊀收稿日期:2019 ̄09 ̄05瘤胃微生物RNA提取中样品前处理方法的优化
刘思佳ꎬ赵圣国ꎬ郑㊀楠ꎬ王加启∗
(中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养国家重点实验室ꎬ北京㊀100193)红星闪闪 歌词
摘㊀要㊀通过优化瘤胃液前处理方法ꎬ提高瘤胃微生物RNA提取数量与质量ꎮ试验优化4个前处理条件ꎬ共组合形成5个处理组ꎮ前处理完成后ꎬ利用Trizol进行RNA提取ꎬ检测RNA浓度和完整度(RIN)ꎮ结果显示ꎬ提取瘤胃内容物和瘤胃菌体RNA浓度和完整度的影响没有显著差异(P>0.05)ꎮ液氮保存的样品提取的RNA浓度和完整度均显著(P<0.05)高于RNA保护液保存的样品ꎮ解冻处理对RNA浓度的影响无显著差异(P>0.05)ꎬ但是不解冻处理提取的RNA完整度显著高于解冻处理(P<0.05)ꎮ液氮冷冻研磨提取的RNA瑞士国际酒店管理大学>九州缥缈录什么时候播
浓度(P<0.05)显著高于常温研磨ꎬ但是对RNA完整度的影响没有显著差异(P>0.05)ꎮ瘤胃内容物㊁液氮速冻㊁不解冻处理结合冷冻研磨方法所提取RNA的RIN值为9.43ꎬ完整度最高ꎮ瘤胃内容物㊁液氮速冻㊁解冻离心收集菌体结合冷冻研磨方法所提取的RNA浓度为1048ng/μLꎬ为最高浓度ꎮ因此ꎬ瘤胃内容物直接液氮速冻并在不解冻条件下冷冻研磨ꎬ所提取的RNA效果最好ꎬ可用于后续宏转录组学试验ꎮ
关键词㊀瘤胃液ꎻ前处理ꎻ破碎温度ꎻRNA提取ꎻ优化ꎻRNA质量4年级下册数学期末试卷答案
中图分类号㊀Q93-3㊀㊀㊀文献标识码㊀A㊀㊀㊀文章编号㊀1005-7021(2020)01-0088-06
doi:10.3969/j.issn.1005-7021.2020.01.012OptimizationofSamplePretreatmentinRumenMicrobialRNAExtraction
赚钱行业LIUSi ̄jiaꎬZHAOSheng ̄guoꎬZHENGNanꎬWANGJia ̄qi
(StateKeyLab.ofAnim.NutritᶄnꎬInst.ofAnim.Sci.ꎬChineseAcad.ofAgric.Sci.ꎬBeijing100193)Abstract㊀Th目字旁的有什么字
eaimofthisstudywastooptimizethepretreatmentofrumenfluidandimprovethequantityandqualityofRNAextractioninrumenmicrobes.Fourpretreatmentconditionsintheexperimentwereoptimizedꎬandthetotalcombinationstoformfivetreatmentgroups.AfterthepretreatmentcompletedꎬRNAwasextractedwithTrizolꎬandde ̄tectedtheRNAconcentrationandintegrity(RIN).TheresultsshowedthattheconcentrationandintegrityofRNAex ̄tractedfromrumencontentsandrumenmicrobialcellshadnosignificantdifference(P>0.05).TheconcentrationandintegrityofRNAextractedfromsamplespreservedandgroundinliquidnitrogenweresignificantlyhigherthanthosepreservedinRNAprotectionsolution(P<0.05).TherewasnosignificantdifferenceintheeffectofthawingtreatmentonRNAconcentration(P>0.05)ꎬhowevertheintegrityofRNAextractedbyrumenfluidwithun
thawingtreatmentwassignificantlyhigherthanthawingtreatment(P<0.05).TheconcentrationofRNAextractedinliquidnitrogenfrozenandgroundwassignificantlyhigher(P<0.05)thanthatgroundinroomtemperatureꎬbuttherewasnosignificantdifferenceintheeffectofRNAintegrity(P>0.05).TheRINvalueofRNAextractedfromrumencon ̄tentsinliquidnitrogenquick ̄freezingandunthawedcombinedwithfreeze ̄grindingmethodwas9.43ꎬtheintegritywasthehighest.TheconcentrationofRNAextractedfromrumencontentsusingliquidnitrogenquickfreezingꎬthawedandcentrifugedtocollectmicrobialcellscombinedwithfreeze ̄grindingmethodwas1048ng/μLꎬwhichwasthehighestconcentration.Thereforeꎬdirectliquidnitrogenquick ̄freezingandgrindingunderunthawingconditionꎬtherumen88微生物学杂志㊀2020年2月第40卷第1期㊀JOURNALOFMICROBIOLOGYFeb.2020Vol.40No.1

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