柯南主线全剧情超详细分析[完美排版图文并茂][全集PDF珍藏版]_百度文...
（柯南主线篇）
划破黑暗的银子弹！与组织对决的历史
第一阶段：变小的名侦探！搜寻黑衣组织的历程 (1)
第二阶段：两个黑衣组织的女子！满月之夜的推理对决 (5)
第三阶段：魔鬼之音！银子弹的镇魂曲 (48)
第四阶段：双面间谍！赤井OR波本？ (76)
第一阶段：变小的名侦探！搜寻黑衣组织的历程
这一部分从001集（云霄飞车杀人事件）开始到128集（黑暗组织10亿元抢劫事件）结束，主要围绕柯南展开，讲述了新一在游乐园被GIN灌下毒药变成柯南，然后寄宿在小兰家一边解决日常案件，一边秘密寻着组织的蛛丝马迹。在这期间，是柯南一个人搜寻组织线索，主要目的是APTX4869的解药。
001云霄飞车杀人事件，新一和青梅竹马的毛利兰一起去多罗碧加游乐场玩，在乘坐云霄飞车时遭遇了杀人事件。
成功解决案件后，新一跟踪两个神秘的黑衣男子，并目击了一名黑衣男子进行现金交易的现场，正当他全神贯注的时候，不料另一名黑衣男子突然从背后出现，将新一击倒，并灌下了组织新开发的毒药，
新一感觉自己的骨头都要裂开了……
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002董事长千金事件，在被警察救醒后，新一发现自己的身体竟然退化到了幼年时期。新一在家门口遇到了阿笠博士，并使他相信自己就是变小了的新一。为了隐瞒新一还活着的事实和不连累身边的
人，新一听从了博士的忠告，决定隐姓埋名。正巧这时小兰来访，在被问及名字时新一灵机一动，自己取名为江户川柯南蒙混了过去。为了获得黑衣组织的情报，柯南借着小兰父亲是侦探之便，以寄养的身份住进了小兰的家里。谁知道毛利小五郎是个糊涂侦探，已经好久没有生意上门了，还埋怨新一抢了他的风头。正巧这时有人来报案说董事长的女儿被黑衣男子，柯南立刻跟了过去，并暗中帮助小五郎解决了这件案子，却发现和黑衣组织没有什么关系。
从此柯南在毛利事务所潜伏了下来，一边帮助毛利解决案件，一边寻访着黑衣组织的蛛丝马迹。
005新干线大爆破事件，柯南在火车上遇到了前次的两名黑衣男子，阻止了两人引爆新干线列车杀人灭
口的计划，并成功得知了两人的代号――GIN和VODKA。
013奇怪的寻亲杀人事件，组织成员宫野明美（化名广田雅美）为了助妹妹宫野志保脱离组织，策划了十亿元抢劫事件，得手后却不幸被GIN杀，临终前她向柯南透露这是一个笼罩着重重迷雾的庞大组织，组织的颜是黑。
043江户川柯南诱拐事件，新一的父母从博士处得知其变小，母亲化装成江户川文代，父亲化装成暗夜公爵，伪装成黑暗组织成员与柯南开玩笑。
054电玩公司杀人事件，在参加满天堂游戏公司的新作发布会时，柯南意外听见黑衣组织成员之一的Tequila给VODKA打电话。不过Tequila旋即被误炸身亡。
他本来的目的是想与电玩公司职员中岛交易获得全世界最有才华的程序设计师的名单，柯南迅速赶往中岛经常与之见面的酒吧时，那里却发生了爆炸，线索也随之灰飞烟灭。
灰原哀多少集出现的
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118浪花连续杀人事件，连续杀人犯沼渊已一郎登场，后来得知他只是组织里的小角，是组织培养杀手的失败作品。
128 黑暗组织10亿元抢劫事件，因为之前与漫画对应的“013奇怪的寻亲杀人事件”被改编，因此动画在这里添了一集，重新讲述了灰原的宫野明美被琴酒所杀的情节，为之后灰原出现作铺垫。通过GIN 与宫野明美的对话我们得知，与仅仅是组织小卒的不同，宫野志保是组织里少数有头脑的人之一。
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第二阶段：两个黑衣组织的女子！满月之夜的推理对决
两个黑衣组织的女子指灰原和VERMOUTH 。
这一部分从129集（来自黑暗组织的女子、大学教授杀人事件）开始到361集（帝丹高中的学校怪谈）结束，主要围绕灰原展开，讲述了宫野志保吃下APTX4869变小为灰原哀逃出组织到了柯南，而组织的得力干将GIN ，VERMOUTH 等人又开始四处搜寻叛徒，连FBI 也牵扯了进来，从此柯南就陷入了一边隐藏身份躲避组织追捕宫野志保的触角，一边窥测组织计划加以阻止的危机四伏的旅途。
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件，组织代号SHERRY 的宫野志保因被杀以停止APTX4869研究的方式表示抗议，结果被组织囚禁在瓦斯室。绝望的她服下了藏着的APTX4869想要自杀，没想到与新一一样没被毒死而身体缩小成儿童时期模样，得以挣脱了手铐从垃圾信道逃了出来。

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