Illumina测序仪器故障问题处理(Troubleshooting)总结
前言
本文的编写旨在指导实际生产，达到及时处理状况、最大化减少损失的目的。提纲是按照试验流程进行编写，以便于快速准确查询。内容大部分由生产经验总结而来，但实际生产状况繁多，本文不能一一列举，需要大家摸索原理、看到问题的本质，以本文为参考做到触类旁通，灵活有效地处理状况。需要谨记的原则是，人为操作更少、风险更低、损失更低的方案优先执行。
cBot
1. 开机
1.1. Error on startup
现象描述：
cBot在开机过程中屏幕变白，提示“cBot Error on startup”，如下图所示。
解决方法：
断电重启仪器，点击“OK”，关闭电源按钮，再打开电源按钮，正常开机。
1.2.通讯连接问题
现象描述：
一般出现在cBot开机后不久，提示通讯连接的问题，以下图为例，提示了barcode reader/canner连接出现问题。
解决方法：
（1）有时刚开机操作过快会出现该类情况，退回主界面，shut down cBot，重新开机，开机后稍等一会再进行操作，如果还提示该错误，参见下一个方法。
（2）点击“MENU”——“Configure”——输入admin，回车——点击“MENU”选择FSE模式，cBot会重启到windows模式——右键电脑“Manager”——到device manager把ports里面的com1删掉（对应报错提示的com），重启切回cBot模式，可能会再提示错误，再断电重启。
1.3.syringe/pump占用或卡住
现象描述：
一般出现在欲进行Wash时，提示syringe/pump被占用或卡住，如下图所示。
解决方法：
网络连接被重设 （1）退回主界面，断电重启仪器，如果无效，参见下一个方法。
（2）点击“MENU”——“Configure”——输入admin，回车——点击“MENU”选择FSE模式，
cBot会重启到windows模式——右键电脑“Manager”——到device manager把ports里面的com全删掉——到USB controllers，逐个卸载USB设备，直至鼠标键盘无反应，关闭电源按钮，重启仪器。
2. Precheck
2.1. Precheck Failed
现象描述：
在开始一个Run前要进行Precheck，不通过会提示“Failed“，左上角窗口有详细说明。
解决方法：
（1）物品安放问题，进行Precheck需要物品齐全、安放正确及合上盖子，检查物品是否齐全、安放是否正确，盖子盖上后不要太快打开。
（2）液路问题，重新安放FC和Mainfold，把FC和平台擦拭干净，FC往左下方靠，Mainfold垂直扣下压紧，如果仍然不通过，尝试更换Mainfold；更换Mainfold还是不通过的
话，可能是注射器问题。
3.运行Run中
cBot运行一个Run中可能发生错误而停止，原因可分为机械碰撞和通讯卡顿两类。
3.1.机械碰撞类报错
现象描述：
如下图所示，提示“Hit…”，打开盖子会发现Mainfold折断或物品易位等异常情况。
解决方法：
首先，小心记录所有信息，最好是清晰的图片。然后观察分析，结合Recipe推出实际运行到了哪一步，因为发生故障时cBot可能没有立即停止，显示的Status与实际不符。如果显示的Status与实际相符，选择方法（1）；如果不相符，若还没开始扩增，选择方法（2），若已开始或完成扩增，选择方法（3）。
（1）cBot有恢复功能，退回到主界面，中央“START”下边显示了“recover is available”表示可以恢复刚才故障的Run，将物品放好，点击“START”会进入Precheck界面，通过后START即可。
（2）可通过将结合上的模板变性冲走还原FC，可参考如下方法：准备试剂HT2、LDR和HT1；点击“MENU”——“Manual Commands”——“Temp”，将平台升温至55℃，速率1℃/s；选择“Pump”，pump试剂LDR 100μL，速率60μL/min；pump试剂HT2 200μL，速率60μL/min；pump试剂HT1 100μL，速率60μL/min，完成后该FC可作为新FC使用。
（3）若扩增已开始但没完成，尽量推断出进行多少循环，然后参照Recipe手动完成后续步骤；若扩增已完成，只需手动结合引物即可，也可以用重杂程序进行。
3.2.通讯卡顿类报错
现象描述：
以下图为例，报错提示pump卡住，无法继续。
解决方法：
首先，小心记录所有信息，最好是清晰的图片。然后观察分析，结合Recipe推出实际运行到了哪一步。需要先解决通讯的问题，参见“开机”章节；再解决该Run问题，参见上一节“机械碰撞类报错”的解决方法。
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